Tohle slovní spojení používám, když vím, že určitá věc prostě
jinak nejde nebo nepůjde. Pěkně to vystihli v duchu anglického šarmu v tom
seriálu Jistě pane ministře .. větou .. Vlak se taky nedá svést ze své
cesty, ale pojede jen tam, kam mu natáhnete koleje. 
Z Jistě pane ministře jsem moc neviděla, ale znám a není špatný, ale
říká se, jak jsi popsal, že to souvisí s vlakem, kolejemi, že s ním
nehneš. Jenže každý vlak může vykolejit.
Jde o to, jak to kdo bere, jestli "nejede vlak", jako že něco nesnese za
žádnou cenu, nebo "nejede vlak", že s něčím, někým nehneš. :) Toť
otázka.
Vidím to spíš z pohledu toho že se v kontextu slovního spojení "Přes
to nejede vlak" se nejedná o řekněme příkazový řádek ale o pouhé
konstatování, stejně jako ten vlak který bez kolejí nikam nedojede ..
U mě nejede vlak přes to, když potkám člověka, který je na můj vkus
moc sobecký. Nemám problém se s ním bavit, ale svůj čas s ním nerada
trávím a nevyhledávám jeho společnost. To je asi jediné, kdy u mě přes
to nejede vlak, jinak zastávám pravidlo, že když se chce, všechno jde.
Samozřejmě, pak jsou chvíle, kdy něco nemůžeš ovlivnit, i kdyby ses
zbláznil, ale to pak, jak se říká, přes to nejede vlak a nemá smysl, se
tím jakkoliv trápit a užírat. 
1